Opis studiów
Zasadniczym celem studiów I stopnia jest wykształcenie w studentach podstawowych umiejętności, wiedzy i kompetencji z zakresu bioinformatyki pozwalających im na samodzielne rozwiązywanie problemów z pogranicza informatyki i współczesnej biologii.
Bioinformatyka jest kierunkiem dla kandydatów zainteresowanych biologią molekularną i technikami informatycznymi, którzy chcą podejmować wyzwania nowoczesnej biologii. Wiedza teoretyczna i praktyczna zdobyta na studiach pozwala posługiwać się narzędziami informatycznymi służącymi do analizy olbrzymich i wysoce złożonych zbiorów informacji biomedycznych (Big Biomedical Data). Absolwenci potrafią posługiwać się nowoczesnymi metodami bioinformatyki oraz biologii obliczeniowej, operować współczesnymi technologiami informacyjnymi oraz potrafią je zastosować w badaniach biomedycznych i biologii molekularnej. Ponadto absolwenci potrafią zaprojektować i skonstruować własne narzędzia informatyczne służące do rozwiązywania konkretnych problemów biologii molekularnej.
Kształcenie
- bioinformatyka sekwencji obejmuje analizę porównawczą oraz funkcjonalną genomów, transkryptomów i proteomów
- bioinformatyka strukturalna obejmującą badanie struktur przestrzennych kwasów nukleinowych i białek, ich porównywanie, klasyfikację i modelowanie
- bioinformatyka ewolucyjna związaną z rekonstrukcją pokrewieństw ewolucyjnych oraz składaniem genomów i ich porównywaniem
- bioinformatyka systemowa obejmującą modelowanie procesów biologicznych na różnym poziomie organizacji życia, od komórkowego po ekologiczny
- opracowywanie nowych metod analizy obliczeniowej danych biologicznych poprzez tworzenie oprogramowania bioinformatycznego.
Atuty kierunku
Kierunek wyróżnia się bogatą i różnorodną ofertą przedmiotów i zajęć o charakterze praktycznym. Program studiów stworzono we współpracy z pracodawcami i firmami bioinformatycznymi (m.in. Roche, Ardigen, GenXone S.A.) wzbogacając go o dodatkowe formy kształcenia (np. kursy i staże w firmach z branży bioinformatycznej). Umożliwi to zdobycie unikalnych i poszukiwanych na obecnym rynku pracy kwalifikacji.
Studia pozwalają kreować indywidualne ścieżki kształcenia i pogłębiania zainteresowań studentów. Odbywa się to poprzez wybór przedmiotów obieralnych oraz odpowiedni dobór tematyki pracy licencjackiej i praktyk studenckich. W programie studiów, każdy z wymienionych wyżej obszarów tematycznych reprezentowany jest przez szereg przedmiotów obowiązkowych i obieralnych. Dzięki nim student zdobywa wiedzę teoretyczną (wykłady i konwersatoria), jak i praktyczną (zajęcia komputerowe, laboratoria, wizyty studyjne w firmach z branży bioinformatycznej).
Specjalności w ramach kierunku
Na kierunku nie wyodrębniono specjalności, jednak szeroka paleta przedmiotów fakultatywnych umożliwia studentom skoncentrowanie się na wybranych aspektach bioinformatyki – np. analizie danych genomowych, algorytmice czy bioinformatyce strukturalnej.
Sylwetka absolwenta
Absolwenci otrzymają tytuł zawodowy licencjata i będą mieli możliwość podejmowania pracy w:
- krajowych i zagranicznych laboratoriach bioinformatycznych, diagnostycznych i badawczych,
instytucjach naukowo-badawczych
- w przedsiębiorstwach zajmujących się tworzeniem i rozwojem oprogramowania bioinformatycznego (np. na potrzeby diagnostyki medycznej)
- w działach badawczo-rozwojowych firm farmaceutycznych zajmujących się m.in. poszukiwaniem nowych leków
- jednostkach doradczych i projektujących procesy biotechnologiczne
- instytucjach zajmujących się obsługą biologicznych i medycznych baz danych
- jednostkach administracji publicznej
Program studiów
# |
Nazwa przedmiotu |
Prowadzący |
Pkt. ECTS |
Forma zaliczenia |
1 |
Statystyka z elementami rachunku prawdopodobieństwa
|
prof. dr hab. Waldemar Wołyński |
5 |
Egz. |
2 |
Struktura i funkcja cząsteczek biologicznych
|
prof. dr hab. Mikołaj Olejniczak |
5 |
Egz. |
3 |
Wprowadzenie do systemu Linux
|
prof. UAM dr hab. Krzysztof Dyczkowski |
5 |
Zal. |
4 |
Podstawy programowania w języku Python
|
dr Andrzej Zieleziński |
4 |
Zal. |
5 |
Algebra liniowa
|
prof. UAM dr hab. Maciej Radziejewski |
3 |
Zal. |
6 |
Biologia komórki
|
prof. dr hab. Hanna Kmita prof UAM dr hab. Andrzej Lesicki |
5 |
Egz. |
7 |
Podstawy teoretyczne biologii
|
prof. dr hab. Przemysław Wojtaszek dr hab. Anna Skoracka |
3 |
Zal. |
# |
Nazwa przedmiotu |
Prowadzący |
Pkt. ECTS |
Forma zaliczenia |
1 |
Matematyka dyskretna
|
prof. UAM dr hab. Wojciech Florek |
5 |
Egz. |
2 |
Algorytmy i struktury danych
|
prof. UAM dr hab. Stanisław Gawiejnowicz |
5 |
Zal. |
3 |
Biologia molekularna
|
prof. dr hab. Zofia Szweykowska-Kulińska dr hab. Michał Rurek |
5 |
Egz. |
4 |
Bioinformatyka w technikach biologii molekularnej
|
dr hab. Mirosława Dabert |
5 |
Zal. |
5 |
Bioinformatyka
|
prof. dr hab. Wojciech Karłowski |
6 |
Egz. |
6 |
Ewolucja bioróżnorodności
|
prof. dr hab. Jacek Dabert dr hab. Justyna Wiland-Szymańska |
2 |
Zal. |
7 |
Język angielski
|
- |
2 |
Zal. |
8 |
WF
|
- |
- |
Zal. |
# |
Nazwa przedmiotu |
Prowadzący |
Pkt. ECTS |
Forma zaliczenia |
1 |
Algorytmy w bioinformatyce sekwencji
|
prof. dr hab. Wojciech Karłowski dr Maciej Szymański dr Andrzej Zieleziński |
6 |
Egz. |
2 |
Zastosowanie grafów w bioinformatyce
|
prof. UAM dr hab. Wojciech Florek |
3 |
Egz. |
3 |
Badania wielkoskalowe w biologii molekularnej
|
prof. dr hab. Izabela Makałowska |
6 |
Egz. |
4 |
Regulacja procesów komórkowych
|
prof. dr hab. Artur Jarmołowski |
6 |
Egz. |
5 |
Język angielski
|
- |
- |
Zal. |
6 |
WF
|
- |
- |
Zal. |
Przedmioty obieralne
Punktów ECTS do uzyskania: 7
|
1 |
Technologie internetowe
|
Wydział Matematyki i Informatyki |
3 |
Zal. |
2 |
Programowanie w R
|
dr hab. Lechosław Kuczyński |
2 |
Zal. |
3 |
Wykłady eksperckie
|
Wydział Biologii |
1 |
Zal. |
4 |
Tips and tricks: skuteczne wyszukiwanie informacji i ich wizualizacja
|
dr Sylwia Łukasik |
1 |
Zal. |
5 |
Enzymologia molekularna
|
prof. dr hab. Wiesława Jarmuszkiewicz |
3 |
Zal. |
# |
Nazwa przedmiotu |
Prowadzący |
Pkt. ECTS |
Forma zaliczenia |
1 |
Wprowadzenie do języka C++
|
Wydział Matematyki i Informatyki |
4 |
Zal. |
2 |
Podstawy analizy danych NGS
|
prof. UAM dr hab. Marek Żywicki |
5 |
Zal. |
3 |
Podstawy bioinformatyki strukturalnej
|
dr Jan Brezovsky |
3 |
Zal. |
4 |
Język angielski
|
- |
2 |
Zal. |
Przedmioty obieralne
Punktów ECTS do uzyskania: 16
|
1 |
Sieci interakcji ekologicznych
|
prof. dr hab. Marlena Lembicz dr hab. Anna Skoracka |
2 |
Zal. |
2 |
Mechanizmy regulacyjne zależne od RNA
|
dr Maciej Szymański |
2 |
Zal. |
3 |
Biologia nowotworów i ich mikrośrodowiska
|
dr Agnieszka Knopik-Skrocka |
3 |
Zal. |
4 |
Życie. Czym jest i skąd się wzięło?
|
dr Maciej Szymański |
1 |
Zal. |
5 |
Maszyny molekularne
|
prof. UAM dr hab. Mikołaj Olejniczak |
4 |
Zal. |
6 |
Wykłady eksperckie
|
Wydział Biologii |
1 |
Zal. |
7 |
Biologiczne i biomedyczne bazy danych
|
dr Joanna Ciomborowska-Basheer |
3 |
Zal. |
8 |
Ekologia obliczeniowa
|
dr hab. Lechosław Kuczyński |
3 |
Zal. |
9 |
Teledetekcja i narzędzia GIS w pozyskiwaniu informacji przyrodniczej
|
dr Maciej Nowak |
4 |
Zal. |
10 |
Elementy niespecjalistyczne w pracy absolwenta
|
Witold Hołubowicz |
3 |
Zal. |
# |
Nazwa przedmiotu |
Prowadzący |
Pkt. ECTS |
Forma zaliczenia |
1 |
Bazy danych
|
Wydział Matematyki i Informatyki |
5 |
Zal. |
2 |
Analiza matematyczna
|
Wydział Fizyki |
5 |
Zal. |
3 |
Bioinformatyka mikroorganizmów i wirusów
|
dr Jakub Barylski dr Jakub Baranek |
3 |
Zal. |
4 |
Genetyka ewolucyjna i populacyjna
|
prof. dr hab. Witold Wachowiak dr Mateusz Konczal |
3 |
Egz. |
5 |
Język angielski
|
- |
4 |
Egz. |
Przedmioty obieralne
Punktów ECTS do uzyskania: 10
|
1 |
Bioinformatyka RNA
|
prof. UAM dr hab. Marek Żywicki dr Maciej Szymański |
3 |
Zal. |
2 |
Tworzenie aplikacji internetowych w Django (Python)
|
dr Andrzej Zieleziński |
2 |
Zal. |
3 |
Socjobiologia
|
prof. dr hab. Jacek Radwan |
4 |
Zal. |
4 |
Wykłady eksperckie
|
Wydział Biologii |
1 |
Zal. |
5 |
Analizy kopalnego DNA
|
dr inż. Anna Juras dr Maciej Chyleński |
2 |
Zal. |
6 |
Programowanie obiektowe w C++
|
Wydział Matematyki i Informatyki |
3 |
Zal. |
# |
Nazwa przedmiotu |
Prowadzący |
Pkt. ECTS |
Forma zaliczenia |
1 |
Symulacja procesów biologicznych
|
prof. dr hab. Borys Wróbel |
4 |
Zal. |
2 |
Pracownia licencjacka do wyboru
|
- |
9 |
Zal. |
3 |
Seminarium licencjackie do wyboru
|
- |
9 |
Zal. |
4 |
Praktyki zawodowe
|
- |
4 |
Zal. |
Przedmioty obieralne
Punktów ECTS do uzyskania: 11
|
1 |
Genetyka cech wielogenowych u człowieka
|
dr hab. Alina Bączkiewicz dr hab. Kataszyna Buczkowska-Chmielewska |
2 |
Zal. |
2 |
Wykłady eksperckie
|
Wydział Biologii |
1 |
Zal. |
3 |
Kompresja danych
|
Wydział Matematyki i Informatyki |
3 |
Zal. |
4 |
Bioetyka
|
dr Izabela Rzymska |
2 |
Zal. |
5 |
Genomika populacyjna
|
prof. dr hab. Witold Wachowiak |
3 |
Zal. |
6 |
Mechanizmy epigenetyczne w etiologii chorób człowieka
|
dr hab. Mirosława Siatecka dr hab. Elżbiera Poręba |
3 |
Zal. |
7 |
Wprowadzenie do biogospodarki
|
dr Łukasz Wojtyla |
3 |
Zal. |
8 |
Prezentacja i wizualizacja danych w R
|
Wydział Matematyki i Informatyki |
3 |
Zal. |